Säkerhetslaboratorium

Vi utför analyser avseende Mycobacterium tuberculosis (tuberkulos), atypiska mykobakterier som orsakar svårbehandlad lunginflammation och Francisella tularensis som orsakar tularemi (harpest). För tularemi är Umeå nationellt referenslaboratorium. Laboratoriet har arbetsrutiner, säkerhetsbänkar, undertrycksventilation och filtrerad frånluft för säkerhet både för personalen och omgivningen.

Mycobacterium tuberculosis och atypiska mykobakterier

Direktmikroskopi utförs på luftvägsprover med analys avseende förekomst av syrafasta stavar. Positiv mikroskopi indikerar att patienten är smittsam.

PCR görs direkt på provet för att detektera DNA från Mycobacterium tuberculosis-komplexet samt förekomst av eventuella resistensmutationer.

Odling vilket är “golden standard” pågår i sju veckor. Vid växt artbestäms isolatet med hjälp av DNA-hybridisering.

Resistensbestämning utförs på fynd av Mycobacterium tuberculosis för Rifampicin, Isoniazid och Etambutol. Resistensbestämning för Pyrazinamid görs med genotypisk metod på Folkhälsomyndigheten. Resistensbestämning på atypiska mykobakterier skickas på begäran av kund till Klinisk mikrobiologi på Karolinska Universitetssjukhuset.

Helgenomsekvensering utförs på Folkhälsomyndigheten för analys av klustertillhörighet och genotypisk resistensbestämning.

Francisella tularensis

Klinisk mikrobiologi på Norrlands universitetssjukhus är tillsammans med Folkhälsomyndigheten referenslaboratorium för Francisella tularensis. På säkerhetslaboratoriet utförs PCR och odling.

PCR, specifik för Francisella tularensis utförs direkt från provet. Metoden är validerad för sår, körtlar, abscesser och blododlingar. Analysen utförs på begäran på andra provmaterial men känsligheten är då osäker och serologi rekommenderas.

Odling pågår i sju dagar. Analys avseende F. tularensis, S. aureus och betahemolyserande streptokocker utförs. Analys av övriga agens kan göras utanför säkerhetslaboratoriet om PCR är negativ.

OBS! Det är viktigt att ange misstanke om tularemi på remissen då risk för laboratoriesmitta finns.